连云港市妇幼保健院新生儿科成立于2005年，是江苏省危新生儿急重症救治中心，江苏省妇幼保健重点学科，连云港市临床重点专科省级培育项目，连云港市“十四五”花果山“科教强医”重点学科，连云港市花果山攀峰“高峰”项目，连云港市新生儿质量控制中心。其中有家庭化病房10间。床位数占医院床位比例为13.06%(70/536)。

新生儿科设有两个病区，开放床位数70张，一区为NICU病区，二区为新生儿病区、每层均设有家庭化病房、无陪护新生儿病室、消毒隔离室及哺乳室等。对患儿提供鸟巢式护理服务、母乳喂养支持及袋鼠式护理，具备温控与湿度控制，定期消毒隔离，建有母乳库，宣传和支持母乳喂养技术。

常规开展新生儿重症监护，开展三级儿童医院新生儿科重点专科临床所有必备项目，开展极低超低出生体重早产儿综合管理、新生儿早期康复技术、高危新生儿出院后随访与早期干预管理等。开展家庭化医疗服务，建立有捐赠母乳库，可以为救治极低/超低早产儿免费提供捐赠母乳，目前已经有多位秀珍宝宝获得救助。新生儿科在2022年建立科室内新生儿MRI检查室，是省内第一家拥有第一时间为危急重症新生儿提供安全快速便捷服务新生儿救治中心;新生儿科全天候24小时开展的危急重症新生儿的急救转运服务。