盐城市第二人民医院肝病科，于1993年被市卫生局授予“盐城市肝病研究所”的称号，经过几十年的发展，目前处于全市肝病诊治的领头地位，是长江三角洲传染病医院协作中心常务理事单位，中国医院管理协会传染病院分会理事单位，是长江三角洲重症肝病救治协作组网组单位。

肝病科有两个肝病病区，重点治疗急、慢性乙型肝炎，丙型肝炎，戊型肝炎，各型重症肝炎，各期肝硬化及其并发症（上消化道出血，肝性脑病，原发性腹膜炎、肝肾综合征等）、酒精性和非酒精性肝病、自身免疫性肝病、原发性肝癌等，其诊治水平达国内先进。

肝病科有一综合感染病区，和上海公共卫生中心联合成立了艾滋病之家，是全市定点收治艾滋病的唯一病区，治疗艾滋病相关性疾病。综合感染病区还定点收治其他法定传染性疾病。肝病科在2004年“非典”，2011年的“禽流感”2014年的“埃博拉出血热”的防治中做了许多工作，为全市人民的健康安全作出了奉献。

肝病科内多人担任省、市学科带头人。全科现有医生16人，主任医师5名，副主任医师3名，主治医师2名，住院医师6名，其中医学硕士3人，研究生结业1人，研究生在读4人，本科8人。全科共发表论文100余篇，1人参加专著编写8本，1人被聘为《临床医学》杂志特约编辑。

近年来盐城市第二人民医院新建了一流的感染科病房大楼，设有标准的负压病房和ICU病房。不断完善检验科设备。肝病实验室设备齐全先进，引进美国的5700荧光定量PCR分析仪、可以进行HBV-DNA、HCV-RNA、乙肝病毒抗原抗体的定量检测，最近还开展了乙肝病毒基因型检测及病毒变异位点的检测，以及HIV病毒核酸、CD4淋巴细胞的检测，为临床和科研工作提供了保障。