厦门大学附属厦门眼科中心是集医疗、教学、科研、眼健康为一体的国家三级甲等眼科医院。获得了卫生部国家临床重点专科、国家药物临床试验机构、国家住院医师规范化培训基地、福建省眼科与视觉科学重点实验室、福建省临床重点专科，并设有国家博士后科研工作站、院士专家工作站等，拥有 “全国白内障手术培训基地”、全国住院医师规培基地、全国 “疑难眼病名医会诊平台”以及医联体“远程会诊中心”等重要临床培训研究平台。

厦门大学附属厦门眼科中心2013年，在国家卫计委发布全国医疗机构白内障复明手术例数排名中，获得中华医学会2013年消除白内障突出贡献奖。2011年获得卫生部医管司“改革创新奖”。

经过多年不懈努力，厦门大学厦门眼科中心建立了完备的眼科各亚专科体系、吸引了大量具有影响力的眼科教授，开设了全国眼底病会诊中心、儿童眼病及斜弱视会诊中心等远程会诊平台。

厦门大学附属厦门眼科中心已完成973、863、国家重大研究计划、国家自然科学基金42项，省市级课题40余项，获得三项省部级科技进步一等奖。2014年度中国医院科技影响力排行榜-眼科学排行进入前十。中心具有多名具有国际影响力的专家，包括黎晓新（中华眼科学会荣誉主委、亚太视网膜学会前任主席）、赵堪兴（中华眼科学会荣誉主委、亚太斜弱视与儿童眼病学会前任主席、葛坚（中华眼科学会名誉主委）、刘祖国（亚洲干眼学会候任主席）。承担着国家、省、市专业人才培训、临床试验及国际及医联体多层级人才培训、信息交流共享等任务。

厦门大学附属厦门眼科中心平均每年承办国家级会议培训6次，培训全国骨干约1000人次/年。主办及主导了“2017中国眼底病论坛暨国际视网膜研讨会”、“第三届华厦眼科国际论坛暨第六届国际葡萄膜炎学术研讨会”、“第11届亚太玻璃体视网膜学会大会”等多项国际及国内会议，2019年承办全国斜弱视及儿童眼病会议。

通过多种临床研究协作网络平台，开展“严重糖尿病性视网膜病变的治疗”、“角结膜疾病的基础研究及临床应用”、 “眼组织库的基础研究及临床应用”等研究，并“浅析大陆医保改革及其与台湾病区医保之比较”，提出“我国循证眼科学研究的现状、问题与对策”。为我国进一步优化医疗资源配置、提高医疗资源的合理高效使用提出了科学化的建议。

自建院以来，以厦门大学附属厦门眼科中心为中心，联合全国50余家医院，依托医联体为平台，逐步在全国开展了眼科疾病的社区筛查、治疗、社区管理康复、培训等相关工作。2011年开始，厦门大学附属厦门眼科中心承担了医联体全国信息网络平台的建设工作，该系统登记录入全国眼部相关疾病患者的人口学信息和诊断、治疗、康复等随访信息。