海南省人民医院儿科分为小儿内科和小儿外科2个科室：
小儿内科
海南省人民医院儿科建制于1956年，是我省建制最早的儿童医疗机构。2008年获省儿童危重病救治中心，2009年获省级青年文明号，2010年获省医学重点学科，2019年获海南省重点专科，多次获得先进党支部和优秀带教科室称号。
现有2个院区（床位数146张，秀英病区108张、龙华院区38张）、2个门急诊、3个中心（儿童哮喘诊治中心、儿童癫痫诊治中心、儿童脑瘫康复中心）。儿科现有感染、呼吸、血液、肿瘤、肾病、风湿免疫、消化、心血管、康复、神经、营养保健、遗传代谢、内分泌13个亚专业。
儿童血液肿瘤专科现为全国儿童血液病首批定点医院、海南省急性淋巴细胞白血病救治专家组组长单位，是海南省规模最大的儿童血液及肿瘤专科，开展儿童白血病、噬血细胞综合征、实体瘤等规范化治疗，现已开展骨髓移植及CAR-T细胞治疗，在省内处于领先地位。
儿科重症监护室为海南省急危重症患儿救治中心，每年救治大量危重症儿童，能开展血液净化，严重肺病各类呼吸机通气治疗，纤维支气管镜肺泡灌洗、取异物、病理活检术，脑功能监测，床旁超声、心脏起搏器安装等技术，成功救治暴发性心肌炎、心肌病、脓毒血症、肺出血、ARDS、遗传代谢性疾病、急性中毒、恶性高血压、肾衰竭、肝衰竭、狼疮危象、严重外伤等急危重症。
诊断多例先天性肌病、脂肪代谢障碍、遗传代谢性疾病、肾单位肾痨、杜氏病、免疫缺陷等罕见病。儿童呼吸专科是海南省首家儿童哮喘专家门诊，建立了儿童哮喘免疫治疗中心并获得国际认证，在省内率先开展小儿呼吸道病原学监测及儿童喘息型疾病吸入治疗、皮下舌下免疫治疗和婴幼儿肺功能及呼出气一氧化氮检测等新技术、新项目填补了海南此领域的空白。
教学方面，长期承担海南医学院的临床教学工作、南华大学研究生培养工作、住院医师规范化培训工作、各级医院进修教育，为海南培养、输送大量儿科人才。
小儿外科
海南省人民医院小儿外科创建于2006年1月，是海南三甲综合医院中最早设立的小儿外科专业。随着越来越多的患儿在小儿外科获得治愈，小儿外科医护人员的专业水平和医疗技术赢得海南广大人民群众的信任。本岛患儿足不出岛就能得到专业小儿外科队伍提供的优质专业诊疗服务，社会美誉度极高。
2014年获批为国家级小儿外科住院医师规范化培训基地。2019年获批海南省省级临床重点专科。
现开放床位50张，设置以下亚专业组：小儿泌尿外科组，小儿普外组、新生儿外科组，小儿肿瘤外科组和小儿胸外科组等，为0-16周岁需外科治疗的患儿提供医疗服务。年门诊量约20000人次，年收治病人约3000人次，年手术量约2500人次，可独立完成小儿外科各种常规及疑难复杂手术。
现有小儿外科专科医师11名，护士25名，其中主任医师1名、副主任医师5名、主治医师4名、住院医师1名，具有研究生学位的医师共9人，是海南省内技术力量较强、具有较高专业素养的小儿外科专业队伍。
主要成就：经过近15年的努力，小儿外科已经建立起一整套适合小儿特点的精细操作规程以及专科治疗和护理常规，各亚专业初具规模，已开展的多项手术填补我省小儿外科的空白，成为海南省医疗设施相对先进、技术力量相对雄厚的小儿外科治疗中心。可独立开展小儿各种先天性畸形、急腹症、肿瘤、创伤、泌尿生殖器官疾病的诊治。
小儿泌尿外科亚专业组收治病种包括：尿道下裂、尿道上裂、肾积水、隐睾、隐匿阴茎、重复肾、膀胱输尿管返流、输尿管狭窄、精索静脉曲张、鞘膜积液等。年完成各型尿道下裂手术150-200例，一期手术成功率达90%以上，达到省内领先、国内先进水平。独立开展泌尿系统各类腹腔镜和机器人微创手术。
小儿普外、新生儿外科亚专业组收治病种包括：先天性巨结肠、先天性胆总管囊肿、腹股沟疝、食道闭锁、先天性隔疝、胆道闭锁、十二指肠梗阻、肠闭锁、先天性肛门闭锁等。独立开展小儿普外、新生儿外科各类腹腔镜和机器人微创手术。
小儿肿瘤外科亚专业组收治病种包括：神经母细胞瘤、肾母细胞瘤、各部位畸胎瘤、横纹肌肉瘤、胸腔纵隔肿瘤、淋巴管瘤、血管瘤等。能独立完成复杂的腹膜后神经母细胞瘤手术。
小儿胸外科亚专业组收治病种包括：隔离肺、肺囊腺瘤样畸形、支气管源性囊肿、肺大泡、漏斗胸、鸡胸、膈疝、膈膨升等。