青海大学附属医院呼吸科始建于1988年，由原来的青海医学院附属医院内二科基础上发展起来的，1998年呼吸科正式独立，目前已发展成为一个集医疗、教学、科研于一体的科室，是青海省内最早成立的呼吸专科之一。李焕芬教授是第一任呼吸科主任，当时有人员七人，正高级职称一人，副高级职称两人，中级职称两人，住院医师两人，床位34张，抢救室床位1张。诊治呼吸道各种疾病，包括上呼吸道感染、肺炎、支气管扩张、肺脓肿、肺囊肿、慢性支气管炎、肺气肿、肺心病、呼吸衰竭、支气管哮喘、胸膜疾病、睡眠呼吸障碍性疾病、间质性肺疾病、纵隔疾病等，在呼吸系统疾病的诊治和危重症抢救方面具有丰富的临床经验。在省内率先开展机械通气的治疗，可完成青海医学院临床医学本科、专科的教学及见习、实习工作。呼吸内科是一支团结、务实、进取、勤奋的老中青相结合的学术团队。继李焕芬主任之后，相继有高芬教授和冯喜英教授担任呼吸科主任。多年来，经过几代人的不懈努力，呼吸科得到了迅速的发展，2001年组建了肺功能室、支气管镜室，为进一步提高临床诊疗技术创造了良好的条件。在这段时间内，呼吸内科的临床和科研都取得了很大的进步，人员逐渐增多，科室的基础设施及设备不断完善，临床、教学和科研工作都取得了长足的发展，呼吸内科常见病、多发病及疑难杂症的诊、治方面也取得了很大进步，并采用走出去、请进来的办法，进一步规范了呼吸系统疾病的诊治程序及医疗行为，目前呼吸科主要研究呼吸病学及高原病学，现已具备一定的学科建设规模，拥有技术力量较雄厚的学科团队。2004年被评为院级重点学科。现有主任医师、教授2人，副主任医师、副教授4人，主治医师、讲师5人，其中医学硕士5人，在读博士2人，硕士生导师3人。1人曾在俄罗斯留学2年，1人曾在日本及美国学习半年，其余人员均曾在国内知名医院进修学习1年。月门诊人数4200人，月均入院人数150人。目前科室主要从事肺炎，慢性阻塞性肺疾病，慢性肺源性心脏病，呼吸衰竭，支气管哮喘，肺血栓栓塞症，间质性肺疾病，胸膜疾病、肺癌的治疗研究。门诊常见病种有上呼吸道感染，急性支气管炎，支气管哮喘，肺部感染，慢性阻塞性肺疾病。同时承担外院及该院危重病人的抢救任务，科室主任及副主任承担青海省西宁市的疑难病例会诊。特别是近几年来，学科发展迅速，年门诊量及住院人数明显增加，临床危重、疑难病例诊治水平处于省内领先地位，教学及科研能力大幅度提高。特别是在推广中华医学会呼吸病学组制定的指南及规范治疗呼吸系统疾病方面达到了国内先进水平。2010年在医院成立了慢性阻塞性肺病（COPD）专病门诊；2011年成立了哮喘专病门诊。在门诊有专职医务人员为COPD及哮喘患者建立了门诊档案，为这些患者在专病门诊提供雾化吸入治疗，定期开展患者健康教育督导，提高患者对依从性，督促定期来院随诊，大大的降低了患者急性发作和急性加重的频率，提高了治疗效果。为患者减轻了经济负担，并使患者的肺功能等得到了改善。呼吸科现设床位60张，拥有日本奥林巴斯电子支气管镜及奥林巴斯荧光支气管镜，德国Dragger多功能呼吸机，飞利浦伟康V600呼吸机，无创呼吸机4台，心电监护仪5台，德国耶格牌脉冲振荡多功能肺功能仪2台等多种先进检查、诊断及治疗仪器。近年来，应用国内最先进的肺功能仪，开展了肺功能检测每年6000余例，纤维支气管镜检查年均500余例。多年来出色完成了大量医学教学任务，包括青海大学医学院临床医学本科班、预防医学系、地方病学、麻醉医学、影像医学等本科班的内科学（呼吸病学、高原病等）理论授课及临床见习和实习任务，有着系统的教学计划，完善了医学本科教育教学体系，使临床实践与基础理论教学相结合，发挥了该学科在培养医学人才中的作用。呼吸科是青海大学医学院内科学呼吸病学硕士研究生培养点，2003年获得内科学呼吸病学专业硕士学位授予权，为青海大学教学科研团队，每年主办国家级继续医学教育学习班一期，推广中华医学会呼吸病学分会的呼吸学组制定的指南及规范化治疗等。学科团队具有较强的技术创新能力，长期以来积极开展高原呼吸病学为主要方向的科研和技术创新工作，近年来获得省卫生厅“三新”项目奖励10项。完成课题有：(1)国家八五攻关研究课题三项子课题的设计和实施，获青海省科技进步三等奖(1999)一项。(2)2004年完成了省级课题一项，被评为国内领先水平。获科研成果证书。(3)国家自然科学基金科研课题《高原低氧对头胞他啶药物动力学影响的研究》已结题，被评为国内领先，获科研成果证书。在研项目3项：(1)青海省2004年（农村与社会发展）重大科技攻关项目《青海省高原慢性阻塞性肺疾病肺心病人群防治的研究》课题。(2)人事部2005年留学人员科技活动项目择优资助经费课题《青海高原支气管哮喘的流行病学调查》。(3)中华医学会临床医学慢性呼吸道疾病科研专项《高原低氧环境支气管哮喘发病机制的研究》。另有5项青海大学及青海大学附属医院中青年科研基金项目：(1)青海大学2009年中青年科研基金项目《COPD患者胎盘生长因子水平与肺动脉压及肺功能关系的研究》。(2)青海大学附属医院2009年中青年科研基金项目《不同海拔世居藏族和移居汉族HTF-12、PIGF及VEGF的水平及意义研究》。(3)青海大学附属医院2010年中青年科研基金项目《肺积指标不同检测方式在慢性阻塞性肺疾病诊断中的敏感性分析》。(4)2012年青海省科技厅项目《藏汉民族高原肺动脉高压患者血清肝细胞生长因子水平及肺动脉压力的相关性研究》。(5)2012年青海大学附属医院中青年科研基金项目《高原肺动脉高压大鼠重返平原肺、骨髓微血管密度变化》。(6)2012年青海大学附属医院中青年科研基金项目《水通道蛋白5在高原肺动脉高压发生中的作用》。(7)2013年青海省科技厅应用基础研究项目《青海省藏汉族肺结核患者NAT2基因型与异烟肼药物代谢及肝损害的关系》。