新疆心脑血管病医院神经外科成立于2003年，科室设施齐全，备有国内先进的开颅和介入手术设备和精密显微外科手术器械。包括飞利浦三维立体定位的DSA、双源CT、瑞士先进的手术显微镜及手术实时监控系统，德国开颅器械及高速磨钻，动态及视频脑电图及癫痫定位仪，进口的国际先进的神经外科手术头架及其他先进的手术器械。

在学科建设上，科室以血管神经外科为龙头，显微神经外科为重点，现擅长开展的项目有：急性颅脑损伤、颅骨缺损成形术、脑脓肿、脑血管意外（高血压脑出血）、脑、脊髓肿瘤及血管性疾病手术治疗，功能性神经外科疾病及神经系统先天性畸形的手术治疗。

特别是神经外科脑血管性疾病的介入治疗，如脑动脉瘤、脑、脊髓动静脉畸形、硬脑膜动静脉瘘、外伤性颈动脉海绵窦瘘等疾病的栓塞、急性脑梗塞（6小时内）动脉溶栓治疗、颈动脉狭窄支架置入术等，具有鲜明的神经外科专业治疗特点。