昭通市中医医院眼科前身为五官科，于1982年成立，是国家级重点中医专科、云南省区域中医（眼科）诊疗中心。科室开放床位64张，建有市级名医工作室1个。拥有一个由2名正高职、4名副高职以及主治医师为主的技术团队，科室人员均多次赴北京同仁医院眼科中心、四川华西眼科中心、广州中山眼科中心等知名医疗机构进行研修交流，积极参加国内大型眼科学术研讨会，先后发表中西医论文60余篇，获科技成果奖30余项，使眼科临床诊疗水平不断得以提高。

科室配置有超声乳化白内障手术设备、玻璃体高速切割手术设备、德国蔡司IOL-master、LumeraT眼科手术显微镜、Humphrey750i视野计、眼光学相干断层扫描仪（OCT）、数字化眼底荧光血管造影系统、眼底激光治疗仪、多焦视觉电生理检查仪、眼科专用A/B超声检查仪、超声生物显微镜（UBM）、角膜地形图检查仪、角膜内皮计数仪、非接触眼压计、电脑验光仪、同视机等先进眼科医疗设备。

科室在全市率先开展生物角膜移植术，常规开展各种类型的屈光白内障手术、激光小梁网切除术及各类型青光眼系列手术、玻璃体切割手术、眼外伤及视网膜脱离手术、眼科美容系列手术、准分子激光手术及有晶体眼人工晶体植入术，以及眼表疾病、葡萄膜炎及各种眼底病、激光泪道手术及常规泪道疾病的诊治，近视、远视、弱视的检查及矫正等业务，一直代表着昭通地区眼科诊疗的最高水平。

同时，科室承担着昭通“光明工程”和“白内障手术精准扶贫项目”的重要任务，积极开展“明眸工程”“眼见为实”等公益活动，十余年坚持到各县（区）为大量贫困患者实施了免费白内障复明手术，深受人民群众的好评。