南通市第二人民医院神经内科创建于上世纪80年代末，经过30余年的发展，神经内科成为拥有44张床位的独立病区。科室已建设成为医疗仪器先进、人才队伍基本合理、技术力量较为雄厚，集医疗、教学、康复、科研的综合学科，在南通市及周边地区有一定知名度。

目前是南通市医学重点专科、南通市医学创新团队。是江苏省卒中地图单位和南通市卒中地图单位，南通市卒中联盟单位。2020年通过南通市市级卒中中心验收，近年来神经内科在医院临床科室各项考核指标中名列前茅，近3年两次获得医院医疗质量管理二等奖。

病区设置有神经内科综合病房、神经重症病房、溶栓病房、康复治疗室。门诊有神经内科普通门诊、专家门诊、脑卒中专科门诊、眩晕专科门诊。年收治病人1200余人次，年专科门诊8000余人次。

医护人员20余名，其中专科医师8名，主任医师2名，副主任医师3名，主治医师1名，住院医师2名。硕士学历4名。

科主任、学科带头人马丹主任医师是南通市神经病学会委员，南通市卒中学会常务理事，南通市“三八红旗手”。