南通市第一人民医院中医科始建于1956年，为临床一级科室。下设中医内科、针灸科、中医肛肠科、理疗科，是全国综合医院中医药工作示范单位，第一批江苏省综合(专科)医院示范中医科，江苏省中医重点专科，南通市临床医学创新团队建设单位，南通市中医重点专科。

科室共有医护人员41名，其中医师27名，护理人员14名；高级职称7名；硕士学位17名；国家级委员2名、省级委员7名、市级委员3名；3名医护人员先后赴韩国、日本进行学术交流或专业研修；1名医师援外两年。

目前，科室开展中医心脑血管、中医消化、中医妇科、中医肿瘤、中医内分泌、中医肾病、中医风湿病等专病诊治。在脑梗塞、高血压病、结肠炎、慢性肾功能不全、混合痔、肛周脓肿、肛痿、颈椎病、中风后遗症、浆细胞性乳腺炎、面瘫、晚期肿瘤(保守姑息)等病种的治疗方面有丰富的经验。

根据临床需要能够提供中药饮片、中成药、肛肠多种手术、微波电灼、火罐、牵引、针刀、刺络放血、穴位注射、中药薰药、雷火灸、耳穴埋豆、中频治疗、合和治疗、压力治疗仪、超声波治疗、微创针刀镜等多种中医药特色服务。科室拥有多台中医特色诊疗设备，满足日常诊疗需求。

近年来，科室主持、参与省、市课题10余项；获江苏中医药科学技术奖1项、南通市科技进步奖3项、南通市卫健委优秀中医药项目10余项、国家技术发明专利30余项；先后在国内外专业期刊发表论文百余篇，其中SCI3篇、中华级2篇、核心期刊20余篇。

中医科还承担南通大学医学院本、专科中医学、针灸学教学任务；在南通理工学院健康管理专业中医养生学课堂授课；承担省内外中医相关院校学生临床实习带教等工作。每年举办省级继续医学教育项目。