西北妇女儿童医院儿童呼吸、遗传代谢病科（儿内一科）主要承担儿童呼吸系统、遗传代谢及内分泌系统疾病等的诊疗工作。开设有哮喘专科门诊、呼吸内科门诊、遗传及内分泌门诊，门诊年诊治病人近6万人，住院部年诊治支气管肺炎、支气管哮喘、矮小症、苯丙酮尿症、甲基丙二酸血症等累计3000人，在西北地区具有一定的影响力。
诊疗特色：
科室哮喘专科门诊被中华医学会变态反应分会儿童过敏哮喘学组、中华医学会儿科分会呼吸学组哮喘协作组认定为全国“儿童哮喘标准化门诊”，严格按照儿童哮喘诊治指南进行长期规范化管理。科室目前已熟练开展儿童支气管镜下肺泡灌洗术、黏膜刷检术、全麻下经支气管镜异物取出术、经支气管镜常规检查等气管镜相关技术，已开展的婴幼儿潮气肺功能、儿童及成人通气肺功能、FeNO检测严格按照国家级指南进行检测质控，结果评估。遗传代谢及内分泌专科负责全省先天性疾病筛查阳性患儿的诊治及管理，先天性甲状腺功能减低症、苯丙酮尿症、肾上腺皮质增生症等遗传代谢及内分泌疾病的诊治已达到省内领先水平。
教学科研：
科室近5年在国际期刊共发表SCI文章4篇。科室人员有参与陕西省科技厅项目经历，曾获陕西省科技厅科技成果奖，曾参与遗传代谢性疾病相关书籍的编写，在国内期刊发表论文10余篇。
团队建设：
科室主任：王卫刚
副主任：李风侠
护士长：黄海娟
医疗骨干：14名，其中副主任医师2名，主治医师12名。郭风琴、朱昌琼、刘玲、邓亚楠、张晶、张青、马苗、唐元元、韩喆、褚文慧、金淑娟、高旭、王文娟、秦璇。
护理骨干：怀维娟、姜革莉、韩丹、陈肖燕、李晓菲、罗楠。
西北妇女儿童医院儿童血液肿瘤科（儿内二科），于2015年5月成立，目前承担多项国家级临床研究项目。2015年参加由上海儿童医学中心牵头的全国儿童急性淋巴细胞白血病协作组（CCCG-ALL2015），是西北地区唯一入组医院，该项研究已经取得非常好的疗效，已在国际顶尖期刊发表；同时参加由北京儿童医院前头的全国儿童急性非淋巴细胞性白血病协作组（CCLG-AML2015）、天津血研所牵头的全国儿童急性早幼粒细胞白血病协作组（CCLG-APL2016）。2019年7月正式加入中国血液病专科联盟儿童血液病联盟。
诊疗特色：
急性白血病、淋巴瘤、骨肉瘤、尤文氏肉瘤、横纹肌肉瘤、神经母细胞瘤、肾母细胞瘤、朗格汉斯细胞组织细胞增生症、血小板减少症、粒细胞缺乏症、骨髓衰竭性疾病及各类贫血等，科室重点开展同胞异基因造血干细胞移植、非血缘关系造血干细胞移植/脐血移植及自体移植。在预防、处理移植并发症、白血病复发、移植物抗宿主病（GVHD）的防治和抗感染等方面具有许多成功经验。每年约开展20余例异基因造血干细胞移植术，其中多为极重型再生障碍性贫血、难治/复发性急性非淋巴细胞白血病、先天性骨髓衰竭性疾病等高危、疑难性病例，４年来施行造血干细胞移植达40余例，植入成功率达100%，总体生存率达90%以上。
教学科研：
由上海儿童医学中心牵头的全国儿童急性淋巴细胞白血病协作组（CCCG-ALL2015）目前已取得阶段性成果，我院作为共同第一作者近期将在国际顶尖期刊JAMA发表。
团队建设：
科室主任：潘凯丽
主任助理：武万良
护士长：寇向利
医疗骨干：14名，其中副主任医师3名，主治医师11名。温卓宇、杨晓青、张健、李芝帆、郝丽、李慧、薛宁、文禄、张格、王君兰、杨韩芳、张敏、郭婧、高攀。
护理骨干：杨帆、韩婷。
西北妇女儿童医院儿童心肾科（儿内三科）主要收治各种小儿肝肾疾病、过敏性疾病、风湿免疫性疾病、反复感染、生长发育及代谢性疾病。科室率先在西北地区开展局麻下肝肾穿刺活检术，减少全身麻醉的不良反应，为西北地区领先技术。
诊疗特色：
已开展血液净化技术（血液透析、血液灌流）治疗急慢性肾损伤、重症过敏性紫癜等疾病，技术水平达西北地区一流；同时开展免疫抑制剂及生物制剂的个体化选择及精准用药治疗难治性肾病综合征、风湿性关节炎等疾病；肾脏系统发育缺陷的临床特征与遗传基因学分析，与遗传科联合开展遗传咨询及生育指导；机体免疫状态的动态化检测及精细化管理及过敏性疾病的个体化治疗，包括致敏原规避、免疫耐受诱导、药物/食物干预、菌群调节等。
教学科研：
2016年开科至今，发表II区以上SCI 4篇，Medline 1篇，核心期刊8篇；2019年承办陕西省儿童休克诊治适宜技术培训学习班。参与国家自然科学基金面上项目（82070858）及陕西省自然科学基础研究计划（2020JQ-941）;与陕西省微生研究所开展横向课题协作研究（肠道菌群与免疫/过敏性疾病的关系）。
团队建设：
科室主任：陈国强
护士长：张瑾
医疗骨干：13名，其中副主任医师2名，主治医师11名。陈萧群、薛继红、李文良、李汶静、蒋宁、刘晓晓、朱海涛、卢林林、张伟、高颜、李敏、赵莹、胡双。
护理骨干：宋玲、岳丹丹、马杨阳、张磊、刘金艳、梁丽、王叶。
西北妇女儿童医院儿童神经内科（儿内五科）于2018年成立，目前融医疗、康复、科研、教学为一体，拥有基础扎实的专业团队，设施完备的专科病房，性能先进的检查仪器，形成了对儿童神经系统疾病诊治、随访、教育的特色管理体系。
诊疗特色：
科室下设神经专科病房，神经专科门诊，脑电图室，康复训练室。神经专科病房主要收治儿童神经系统常见疾病如癫痫、热性惊厥、化脓性脑膜炎、脑性瘫痪、重症肌无力等，以及神经系统疑难重症：如难治性癫痫，自身免疫性脑炎、视神经脊髓炎谱系疾病等。神经专科门诊由经验丰富的医师出诊，接诊各类儿童神经系统疾病，根据病情指导专科诊疗。脑电图室配置先进的脑电图仪，开展视频脑电图、动态脑电图等。康复训练室配置康复治疗仪数台，开展脑性瘫痪、缺血缺氧性脑病恢复期、脑炎后遗症等疾病的康复治疗。
特色业务有：难治性癫痫的生酮饮食治疗，基于临床、电生理与基因型的精准治疗，癫痫性脑病的基因型精准诊断及治疗；神经系统发育缺陷的临床特征与遗传基因学分析，制定干预方案，并与相关科室联合开展遗传咨询；针对进行性肌营养不良进行多器官系统的评估，制定个体化的综合管理和家庭康复指导；肠道菌群在癫痫等神经系统疾病中的辅助干预效应，进行长期随访和评估。
教学科研：
科室近3年获得省级科研项目2项，发表期刊论文10余篇，其中SCI收录论文4篇。每年承担住院医师规范化培训以及各县市进修人员的教学工作。
团队建设：
科室副主任：张小鸽
护士长：史巧维
医疗骨干：16名，其中副主任医师1名，主治医师14名，技师1名。刘鸿丽、姜永生、宋婷婷、陈妞妞、叶雯、郭颖、刘婷婷、于静、吴晓芳、李晓霞、郭丽丽、王悦宁、王晓格、张曦、何含含、陈花。
护理骨干：高华、赵婷、郭海霞、王晓雪、赵娜娜、纪小静、张敏敏、王春蕊、王晓雪、杨小丽。