陆军军医大学第一附属医院临床心理科是应卫生部三等甲级医院须设立心理门诊的规定要求，于1990年成立，是重庆市首家在综合医院开展此项工作的单位。

随着社会节奏的加快，生存压力的加剧，人与人之间的隔离和生疏，患心理障碍、心理疾病的人越来越多，综合医院已成为心理疾病患者主要选择求助的医疗机构，为了顺应社会对心理服务的需求，心理门诊工作人员通过自身的不断探索与诊治水平的不断提高，于2000年成立了临床心理咨询中心（院级中心），隶属神经内科。

为了贯彻执行总部对心理卫生工作的重视，与心理卫生工作在部队的落实，院党委及时把握疾病谱的变化与动向，于2009年5月正式成立了临床心理科。

目前，科室占地面积近450平方米，设有七个功能治疗单元。为了适应医学模式转变，科室率先在重庆市开展心理治疗，变传统药物治疗为药物联合心理的整合治疗，是在西部地区及全军开展心理治疗最早的单位之一。

目前，科室开展的心理治疗手段有十余种，包括认知行为、精神分析、催眠、人本主义、生物反馈、团体治疗等，专设了军人心理咨询门诊及军人心理咨询专线电话。是目前军内开展心理治疗手段最完善的单位之一。

2009年10月，在陆军军医大学承办的全军心理卫生工作座谈会上，我科作为唯一的临床现场展示点，接受了全军心理座谈会各级领导及专家检查，得到与会领导和专家高度评价与认可。2010年获总后获批“全军临床心理治疗中心”。