西南医科大学附属中医医院胸心外科为院级重点科室，现有医护人员共30人。其中医生13人，正高级职称3人，副高级职称3人，中级职称6人，具有医学博士学位2人，医学硕士学位7人，硕士生导师2人。科室常规开展肺部疾病、食管疾病、纵隔疾病、胸壁疾病诊治及严重胸部损伤的治疗。年手术量约600台。近年来胸腔镜微创手术发展迅速，约80%患者均行胸腔镜微创手术，常规开展如胸腹腔镜联合食管癌根治术、全腔镜纵隔肿瘤切除术、自主呼吸麻醉下单孔胸腔镜手术、胸腔镜肺叶切除、肺段切除，交感神经疾病（手汉症，雷诺氏病等），川南地区第一例胸腔镜下肋骨骨折内固定术，在川内较早开展气管隆突重建，双袖式肺叶切除，胸部巨大肿瘤切除，胸骨肋骨肿瘤的切除3D打印重建手术等国内领先技术。近年来心脏大血管方面在北京阜外医院及北京大学国际医院的帮助下，发展迅速。目前常规开展体外循环下及非体外循环下冠脉搭桥术，体外循环下心脏瓣膜置换术、心律失常的外科手术、复杂先天性心脏病矫治术、心脏肿瘤及心包大血管手术等，省内独家食道超声引导下房间隔缺损封堵术，DSA下主动脉瓣疾病及动脉瘤的介入治疗，效果良好。其中近40%为急危重症患者，为外院拒绝治疗患者。开展3D打印技术，使心脏病变术前可视化，减少术后并发症的发生。心脏手术量逐年增加。