苏州大学附属儿童医院普外科，是江苏省临床重点专科，承担着苏州及邻近地区儿童消化道先天畸形、小儿实体肿瘤等疾病的诊治、科研和教学工作。科室现有两个病区，住院病床104张，年手术量7000余例，拥有腹腔镜操作系统和超声切割刀系统等先进硬件设备。现有医师21人，其中主任医师3人、副主任医师5人，教授1人、副教授2人，博士生导师1人，硕士生导师3人，1人为江苏省重点学科“儿科学”首席学科带头人，多人分别在中华医学会小儿外科学分会及江苏省医学会小儿外科学分会任委员、主任委员等职，多年来培养博士、硕士研究生100余名。近年获得“教育部科学进步奖”、“江苏省科技进步奖”、“江苏医学科技奖”、“江苏省卫生厅医学新技术引进奖”、“苏州市科技进步奖”等奖项十余项。

对先天性消化道畸形如食道闭锁、膈疝、肠闭锁、巨结肠、肛门闭锁、胆总管囊肿、胆道闭锁、门静脉高压、便秘及大便失禁等疾病诊治有丰富的临床经验。2001年以来在传统手术的基础上引进了腹腔镜技术，开展小儿微创技术，应用于先天性巨结肠、肠旋转不良、肠闭锁等消化道畸形，胆道闭锁、先天性胆总管囊肿，实体肿瘤等。开展新生儿和婴幼儿手术后及麻醉后应激反应的相关临床研究、胰胆管合流异常的相关临床研究，及新生儿胃肠外营养和新生儿脓毒血症的临床研究，达国内先进水平。对各种小儿实体肿瘤有丰富诊治经验，如肝脏肿瘤、神经母细胞瘤、横纹肌肉瘤、淋巴瘤、畸胎瘤、血管瘤等。