常熟市第二人民医院感染科，是我市唯一收治传染病的重点专科，设床位80张，拥有主任医师2名，副主任医师3名。在各类传染病如慢性乙型肝炎、重型肝炎、麻疹、水痘、腮腺炎、乙脑、流脑、肺结核及伴有并发症的难治性结核的诊治方面积累了丰富的临床经验。

肝病防治中心是市内唯一经主管部门批准的正规治疗传染性肝炎、肝硬化、脂肪肝、酒精性肝病、药物性肝炎等各类肝病的专业机构，率先在本地区开展慢性乙型肝炎规范化抗病毒治疗，人工肝支持系统治疗重型肝炎。中心拥有先进的检测仪器和技术，开展的乙肝病毒基因（HBV-DNA）定量、肝纤维化血清学标志等项目的监测及肝穿活检、腹水超浓缩回输治疗顽固性腹水、耐药结核菌的治疗等先进技术居本市领先地位。有多项研究成果获市级科技奖。