吉林大学第二医院儿科诊疗中心起源于1936年伪满新京市立医院儿科；1965年儿科整体迁入一院。1984年重新组建儿科；2005年儿童保健并入儿科，后更名为发育儿科；2013年4月成立新生儿科（含儿童重症）；2014年成立“儿科疾病诊疗中心”；2018年5月成立儿外科，至此儿科诊疗中心设儿内科、新生儿科、小儿重症、儿外科、发育儿科5个亚专科、8个医疗学组。目前在院内构成全生命周期发育健康枢纽学科群。中心有医、护、技260余人，其中主任医师10人，副主任医师8人。是中国-东盟妇幼健康合作中心中方成员单位、国家级儿科住院医师规范化培训基地、国家新生儿专科医师培训基地、全国新生儿科医师医联体骨干单位、中华护理学会新生儿专科护士临床教学基地、吉林省卫生计生委“儿童发育性疾病筛查”培训基地、吉林省新生儿危重症救治转运中心及临床医学研究中心、吉林省妇幼保健协会儿科主任委员单位、长春市重点专科。医疗特色儿科诊疗中心覆盖3个综合门诊，1个住院疗区；开放床位300张；实现多种疾病院内MDT诊疗模式。儿内科省内率先开展MODY、线粒体糖尿病、单基因糖尿病及1型、2型糖尿病精准分型诊疗、实时动态血糖监测和胰岛素泵系统；率先开展儿童肾脏疾病腹膜透析治疗、小儿常见肿瘤的术前术后评估及化疗；与皮肤科、眼科、耳鼻喉科开展儿童过敏性疾病多学科联合诊治。省内率先成立发育儿科，省内唯一建立完善儿童生长发育全面防治与管理体系。新生儿科致力于为每一位患儿提供从生命救治到身心发展的全程守护，配备各种先进呼吸机、保温箱、一氧化氮治疗仪、亚低温治疗仪、视频脑电监测等设备；目前，成功救治最小胎龄23周、最小体重490g，成功应用ECMO技术救治暴发性心肌炎等极端危重患儿，并创造多个国内、省内第一。小儿外科独立完成早产儿Ommaya泵植入术、早产儿单部位腹腔镜肠闭锁一期吻合术等多个省内首例手术；成功开展腹腔镜治疗高位直肠肛门闭锁、先天性巨结肠根治术、胆总管囊肿切除术以及多系统恶性肿瘤切除等高危高难度手术教学业绩儿科教研室承担本科生、硕士及博士研究生教学，全科住院医师、新生儿围产期医学专科医师、专科护士培训。现有博士生导师5人，硕士生导师13人“唐敖庆学者”英才教授1人。承担省级、校级20余项教学课题研究；发表教学论文40余篇；多名教师获教学奖。教学形式多样化，理论课、技能操作、实习课均采用线上线下混合教学模式。两次获得人卫在线课程和微视频比赛二等奖。教研室连续多年获得教学管理优秀奖、教学管理优秀教研室、教学管理突出教研室教。每年定期举办吉林省儿科学术研讨会和国家级、省级继续教育学习班。科研成绩儿科诊疗中心承担国家自然科学基金面上项目及青年基金项目10项，吉林省自然科学基金、吉林省财政厅卫生专项项目、吉林省国际合作项目、吉林省卫生健康适宜技术扶贫项目、吉林省卫生健康提升项目等省部级项目80余项，科研经费500余万元，获科研成果奖7项，国家级专利1项，发明专利2项，实用新型专利10项；发表SCI杂志、核心期刊杂志论文350余篇；参与制定国家级诊疗规范、指南6项。