南京医科大学第二附属医院急诊医学科是国家级住院医师规范化培训基地，南京市临床重点专科。姜家园院区、萨家湾院区及迈皋桥院区均设有急诊医学科。

目前开设急诊内科、急诊外科、急诊耳鼻喉、抢救室、EICU等急诊单元，共有抢救单元16个，EICU重症床位8张，急诊病房床位37张，清创手术间3间，急诊DSA室1间。与急诊化验室、放射科、B超室、心电图等科室协同合作。

目前共有医护人员119人，医师41人，护师78人。其中主任医师4人，副主任医师12人，主任护师2人，副主任护师12人。

科室拥有有创及无创呼吸机、心肺复苏仪、除颤仪、亚低温治疗仪、纤维支气管镜、超声、主动脉球囊反博机等先进的硬件设施；开展心肺复苏术、气管插管术、机械辅助通气、胸腹腔穿刺、心包穿刺、中心静脉置管、动脉穿刺等一般急救技术；体外肺氧合技术（ECMO）、主动脉球囊反搏术、气管切开术、鼻空肠管置入术、PICCO、纤支镜检查及灌洗术等重点技术项目。擅长脓毒血症、多脏器功能不全、中毒、溺水、重症急性胰腺炎等各种急危重症疾病诊治。24小时为急危重症患者提供快速、全面的急诊急救医疗保障。