中国人民解放军第二五四医院肿瘤科主要针对恶性肿瘤开展预防、诊断、治疗及科研等工作。肿瘤科设备齐全，技术力量雄厚，仪器设备先进；采用放疗、化疗、介入治疗、免疫治疗、生物治疗、基因治疗、物理治疗等综合治疗手段，力求系统化、规范化、个体化治疗肿瘤。

肿瘤科拥有多台大型肿瘤诊治设备：如高新医学影像设备PET、SP-ECT系统；国际先进的三维适形调强肿瘤放疗系统；头部、体部X刀；拓能放疗计划系统以及相应的模拟定位系统。具有一整套规范化肿瘤放化疗方案和综合治疗措施，对肺癌、食道癌、胃癌、大肠癌、卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌、肝癌、乳腺癌及恶性淋巴瘤等全身各部位恶性肿瘤的诊治拥有丰富的经验。

中国人民解放军第二五四医院成立我市第一家肿瘤基因治疗中心，率先引进全球获准上市的第一种基因治疗药物，用于头颈部肿瘤(喉癌、舌癌、甲状腺癌、腮腺癌、鼻咽癌)、肺癌、胃癌、食管癌等肿瘤的治疗，取得显著疗效。