首都儿科研究所附属儿童医院口腔科，现有医师11名、护士5名、技师2名，其中高级职称医师3名，博士生1名。目前口腔科只开设门诊。服务项目主要是儿童口腔疾病的常规治疗，包括牙体治疗，牙周治疗，常见粘膜病治疗，外伤急诊缝合，儿童门诊手术以及儿童牙齿畸形的早期矫治等。已开设专病“口腔黏膜”门诊。

口腔科承担为基层医院培养专业的儿科口腔医生以及北京市多家幼儿园的爱牙宣教任务。与口腔医院共同承担科研课题。