济宁市第二人民医院眼科是市级重点专科，现有医生10人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师2人，住院医师5人，护士10人及专职眼科辅助检查人员，床位26张。眼科手术室采用百级层流净化，保障了手术安全。

科室配有国际上先进的手术设备，引进超声乳化仪、玻璃体切割仪、532nm眼底激光治疗机、非接触性眼压计、眼科专用手术显微镜、裂隙灯显微镜、眼底荧光造影及图像分析系统、眼科A/B超、电脑视野、角膜曲率计、蔡司OCT、视觉电生理仪、同视机、眼前节照相仪等一系列大型眼科尖端设备。眼科承担济宁医学院本专科生临床教学任务，完成市区级科研课题两项，参与国家、省级自然科学基金项目两项。