漳州市中医院肛肠科是漳州的“老牌痔瘘科”，创建于1978年，是福建省漳州市建立较早的中医肛肠专科，经过近40年的发展，成为临床医疗、科研、教学较为完善的中医肛肠专科。现为漳州市中医重点专科单位，是福建省中医药学会肛肠分会副主任委员单位、是漳州中医药学会肛肠专业委员会主任委员单位、省中西医结合协会肛肠分会常务委员单位，是福建中医药大学教学实习基地。

目前拥有46张床位，拥有多功能肛肠病诊疗系统、熏洗系统、微波治疗仪等先进设备。科室技术力量雄厚，拥有医师8人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师4人，其中硕士4人。

学科建立了完善的中西医结合治疗模式，有传统中医药的内服、外用、熏洗等疗法，也有中西医结合的切挂、结扎、注射等疗法，还有微波、激光、PPH（痔上粘膜环切吻合术）、TST（选择性痔上粘膜切除钉合术）、RPH（内痔套扎技术）、多普勒超声引导下痔动脉结扎术等现代疗法，尤其在治疗肛门直肠周围脓肿、高位复杂性肛门直肠瘘和复发性肛门直肠瘘、环状痔、嵌顿性痔等肛肠科疑难症方面疗效优异。

科室自制的坐浴方、痔灵丸、痔疮膏等专科制剂，经过几十年的临床应用，疗效显著，应用广泛。