莆田市第一医院呼吸内科位于3号楼第11、12层，为莆田市最大的呼吸疾病专科之一，拥有主任医师7名、副主任医师3名、主治医师10名，其中博士1名、硕士8名，已成为莆田市呼吸疾病集临床医疗、科研和教学中心为一体的学科，拥有电子支气管镜室、肺功能室及睡眠呼吸检查+治疗室。

科室擅长支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺部感染、肺部肿瘤、间质病、肺栓塞、肺结节等常见病的诊治，对少见疑难危重症亦有较丰富的经验，尤其对危重病人的救治、气管镜检、经皮肺活检、呼吸衰竭治疗、气管支架植入、消融、氩气刀等业务方面颇有特色。