泉州市中医院创建于1953年，是泉州市第一中医诊所的前身，在市委市政府和市卫计委的坚强领导下，于1983年整合市人民医院中医药部分和市中医门诊部，创建泉州市中医院，1995年被国家中医药管理局批准为“全国示范中医院”和“三级乙等”中医医院，2014年批准为“三级甲等”中医医院。
2010年12月市政府投资6亿元建设医院新院区，新院占地173亩，按照“三级甲等”中医医院标准设计，首期建设1000张床位，总建筑面积11.2万平米。主体工程2015年底荣获“中国建筑工程鲁班奖(国家优质工程)”。医院于2015年8月整体搬入新院址，旧院区同时停止服务。
医院是福建中医药大学附属医院及临床医学研究生教学医院、全国住院医师、全科医师规范化培训基地(中医)，是我市集医疗救治、教学科研、预防保健为一体的三级甲等中医医院和泉台中医交流中心。2019年6月份，挂牌“上海中医药大学附属龙华医院合作共建医院”。
人才梯队建设初见成效。现有员工1050人，医生388人，护士414人。高级职称144人，硕士生导师19人，国家中医优秀人才2人，市优秀人才4人，中医学专业博士4人，中西医硕士150人。有国家级名老中医8人，省级名老中医4人，基层名老中医学术经验继承指导老师6人。
重视名老中医学术经验继承工作。有国家级名老中医工作室3个，省级名老中医工作室1个。“泉州留章杰中医针灸”列入省非物质文化遗产代表项目，“泉州留章杰中医针灸传习所”列入市非物质遗产。省中医药学会传承研究分会，国家中医药管理局澄江针灸学派传承工作室二级工作站挂靠医院。
中医重点专科建设初见成效。医院始终以提高医疗质量和服务水平为目标，充分发挥中医药特色优势。现有临床科室20个，医技科室9个。针灸科是国家临床重点专科，脑病科、针灸科等2个专科是国家中医药管理局“十二五”重点专科建设项目，同时还是省医疗“创双高”建设省级临床重点专科(中医类)；省级中医重点专科8个，分别是针灸科、中医妇科、中医肾病科、脑病科、中医肛肠专科、中医骨伤专科、皮肤科、肿瘤科，其中皮肤科和肿瘤科为建设项目；市级中医重点专科有10个，分别是中医肾病、蛇伤科、肛肠科、骨关节病和腰腿痛专科、康复科、脾胃肝胆科、小儿科、不孕不育科、内分泌科、中医妇科，其中儿科、不孕不育科、内分泌科、中医妇科为建设项目；已开展特色浓厚的专病门诊30个。
服务能力大幅提升，群众满意度较高。搬迁后开放床位800张，按照医院建设和学科发展需要，进一步规范中医综合治疗室、心病科、消化科、内分泌科、眼科、男科及ICU等临床科室，推进儿科、妇产科、超声医学科、重症医学科、呼吸内科等薄弱科室建设；增设不孕不育科、肾病科病区，在扩充肛肠二区、康复病区和内分泌病区的基础上，扩充骨伤科及产科病房，整合ICU和急诊科，组建急重症医学部，整合外科病区，开设外科三区；创建肿瘤科粒子专用病房，开展恶性肿瘤I125粒子植入治疗；申报创建无痛病房，建立完善的疼痛评估、治疗、滴定及神经病理性疼痛治疗体系。与中国工程院院士石学敏建立我市卫生系统首个院士专家工作站，聘请第二军医大学附属长征医院骨科贾连顺教授为骨伤科顾问并建立名医工作室，与北京中医药大学东方医院共建高水平中西医结合肿瘤专科，与石狮凤里、湖滨等社区卫生服务中心建立医联体，成立“泉州市中医院针灸康复科、脾胃科、妇科石狮点”。
年门急诊量61万余人次，收治住院人数23万余人次，住院总床日数26万余床日。在全省187家二级以上医院满意度问卷调查中，2017年居第2位，2018年居第7位。
医院是我市西南片区唯一三甲医院，具有明显的区位优势，服务半径辐射泉州市近三分之二的人口，在市政府的支持下，目前的硬件条件也是我省中医医院中首屈一指的。新院建设为医院的发展提供了非常好的平台，医院将始终贯彻习近平总书记在十九大报告中提出的“坚持中西医并重，传承发展中医药事业”要求，积极融入我市医疗卫生体制改革大潮，采用医联体、专科联盟建设等形式，让更多的中医适宜技术推向基层，让更多基层百姓受益。遵循现代医院管理要求制定医院章程，规范内部治理结构和权力运行规则，提高医院运行效率，不断提升学术水平和诊疗能力，充分发挥中医药特色优势，大力弘扬中医药文化，为创建全国名优中医院而不懈努力!