福建医科大学附属第二医院康复医学科，科室将实行康复评定与治疗一体化的服务模式，采用物理治疗（PT）、作业治疗（OT）、言语认知治疗（ST）、感觉统合训练、中医特色治疗以及康复工程等现代康复与传统中医药治疗相结合的手段，为患者提供各种优质、多学科协作的康复医疗服务。

现拥有先进康复设备，包括SET悬吊训练系统、多关节等长等速训练仪、减重支持系统、中药熏蒸床、功率车、电动起立床、PT床、手法床、平衡杆、经颅磁电刺激仪、低频脉冲电疗机、超声波治疗仪、中频治疗仪、骨质疏松治疗仪、牵引椅、磁振热治疗仪、脑循环功能治疗仪、OT桌、电子生物反馈等。

科室拥有一支专业技术精湛、优秀的医疗团队，医护人员20余人，其中医师、治疗师10余人，副主任医师2人，其中博士3人，硕士生导师1人。承担省部级课题2项、厅级等各类课题近10项科研课题，发表相关学术论文50余篇，参编相关医学教程7部。承担福建医科大学、福建中医药大学、泉州市医高专大专、本科生、研究生教学任务。

目前是全国盆底整体康复联盟副理事长单位、国家骨科与康复运动医学中心协作单位、国家区域医疗中心福建省康复专科联盟单位，2022年获批中国康复医学会科普教育基地。获中国中西医结合学会科学技术一等奖1项，陈可冀院士科研奖励基金一等奖1项，第十三届福建省自然科学优秀论文三等奖1项，发明专利2项等。