福建医科大学附属第二医院神经内科成立于1986年，在30多年的发展过程中不断壮大，成为集医教研一体的综合学科和国家级住院医师规范化培训基地。目前拥有3个病区（鲤城与东海院区），120张床位和一支医术精湛、素质过硬的队伍，主任医师8人，副主任医师4人，副教授7人，硕士研究生导师8人。

学科建设取得长足进步，成立脑血管病、头痛眩晕、癫痫、认知与运动障碍以及周围神经疾病等亚专业团队。能进行脑电图、动态脑电监测、肌电图、诱发电位、经颅彩色多普勒超声、神经肌肉活检等检查。

脑血管病的诊断与治疗是本科传统强项。目前本院是国家卫健委脑卒中防治工程委员会认证“高级卒中中心”，“脑卒中筛查与防治基地”和中国卒中学会“综合卒中中心”，常规开展急性脑梗死静脉/动脉溶栓、脑血管造影、血管内治疗等。急性脑梗死静脉溶栓系列研究获得2017年泉州市科技进步奖二等奖和2018年福建省医学科技三等奖。

积极开展脑卒中高危人群筛查与防治工作，多次荣获国家卫健委脑卒中筛查与干预项目“先进集体与优秀个人”称号。本院是泉州市认知与运动障碍质控中心挂靠单位，发挥牵头引领作用，2020年成功开展泉州市第一例帕金森病脑起搏器（脑深部电刺激，DBS）手术。

作为国家级住院医师规范化培训基地，本科常年招收神经内科专业规培学员，负责住院医师培训与管理工作，取得较好成绩。还承担福建医科大学神经病学硕士研究生、临床医学本科生“神经病学”课程的理论教学和临床实践的指导工作。

教学质量高，多位教师获得福建医科大学或临床医学院“优秀教师”等称号。本科积极开展科研工作，先后承担福建省自然科学基金、福建省科技厅、福建省卫健委、福建省教育厅、泉州市科技局等资助的多项课题研究，在国内外专业杂志发表学术论文100多篇，获得国家专利数项。