福建医科大学附属第二医院风湿免疫专业创立于1991年底，并于2019年在东海院区建立独立风湿免疫科病区。风湿免疫科是中国风湿免疫病医联体联盟常务理事单位、福建省风湿病学分会第二届及第三届主任委员单位、福建省医学会变态反应学分会第一、二届主任委员单位、福建省海峡医药卫生交流协会风湿免疫分会会长单位、泉州市风湿病学会第一届主任委员单位及福建医科大学重点培育学科。在福建省医疗“创双高”建设中，取得省级临床重点专科建设项目（免疫学与变态反应专业），此专业省内唯一；顺利通过国家药物临床试验机构资格认定专业，参加药物临床试验及真实世界临床研究；取得中国风湿免疫病医联体联盟颁发的、福建首个“痛风规范诊治中心”和“类风湿关节炎规范诊治中心”的称号；是福建省痛风规范诊治联盟牵头单位。学科是一个以临床为主，医教研并举的风湿免疫病诊疗机构。学科团队人才结构梯队中博士生导师2人、硕士生导师5人，博士4人，硕士10人。团队中有卫生部有突出贡献中青年专家1人，国务院特殊津贴专家1人，担任全国性协会学术委员会副主任员1人，全国性学会协会专业分会常委2人，全国性学会协会青年委员2人。风湿免疫科每年诊治来自以闽南地区为主的福建省内患者及部分港澳台地区患者共计四万多人次。学科常年承担并积极做好住院医师规范化培训及本、专科见、实习的带教任务。1998年开始招收统招学术型硕士研究生，2003年开始招收博士研究生，共培养硕、博士研究生40余位。团队成员参加“十二五”国家重点图书《凯利风湿病学》第八、九版、十版及《哈里森内科学—免疫与风湿性疾病分册》的翻译、校译工作。参编人民卫生出版社出版的《风湿免疫科临床实践(习)导引与图解》一书。担任国家卫计委主办报刊《医学参考报·风湿免疫频道》执行主编。科研方面，实验室依托福建医科大学附属第二医院科研中心作为平台，拥有省内首个获得国家风湿病数据中心认证的风湿免疫病生物标本库、自身抗体检测平台、便携式彩色多普勒关节超声诊断仪，并已形成较为成熟的医学科研服务平台。科室依托本院作为福建省南部区域医疗中心领衔医院的优势，加强医学科学创新体系建设、努力提升临床研究能力，打造福建省免疫疾病临床医学与转化研究高地。