根管治疗的整个过程一般分两到三次完成，不同的治疗阶段安置的药物也会不同。患者初来就诊为缓解牙痛，首先会在牙面上钻洞或者磨除龋坏的牙体组织，牙洞里放无砷失活剂（有效成份为多聚甲醛）是灭活牙神经的药物，这期间患牙有隐痛不必担心，是杀神经的药物在起反应，经过十到十二天复诊，进行机械的根管预备和次氯酸钠等消毒液冲冼后，根管内放氢氧化钙类消炎抑菌的药物观察一周，没有不适症状将患牙用补牙材料填充。在根管治疗期间注意勿用患牙咀嚼以免襞裂。

口腔是需氧菌和厌氧菌共存的环境，所以一般用药会考虑抗需氧菌和抗厌氧菌各用一种联合用药，一般会用头孢类或青霉素类与甲硝唑一起吃，但是消炎药只是能起到暂时缓解的作用，还是建议去医院就诊，查出牙痛的具体原因，再对症治疗。