赣州市人民医院胃肠疝外科是国家临床重点专科建设单位，江西省临床重点专科，赣州市医学领先学科、重点学科。现科室共有55人，其中教授3人，硕士导师3人，省市政府津贴1人，博士1人，主任医师3人，副主任医师（护师）7人，主治医师（护师）12人，医师（护师）26人。

拥有一体化手术室，史托斯超高清3D腹腔镜，肛肠镜，盆底功能治疗仪等先进设备。是赣州市唯一独立设置的规模最大、技术最雄厚、设备最先进的胃肠专业科室。长期以来形成“手术微创化、放化疗规范化、治疗综合化”的特色，和“积极向上、团结协作、共同进步”的科室文化。

在赣州市率先开展了规范化胃肠道肿瘤根治术，腹部免切口腹腔镜胃肠肿瘤切除经阴道/肛门取标本系列微微创手术（NOSE手术），腹腔镜胃癌、结、直肠癌根治术，低位直肠癌保肛手术、腹腔镜疝修补术、痔上黏膜环切术（PPH）、胃肠道瘘综合救治、腹腔镜胃减容（减肥）术以及便秘的手术治疗等新技术。