南昌大学第二附属医院消化内科始建于1958年，经过60余年的发展，现已成为集医疗、教学、科研于一体的临床一线科室。是江西省临床重点专科、江西省高等学校重点学科、“重中之重”学科、国家药物临床试验（消化专业）基地、国家脂肪肝数据管理中心、江西省医学会肝病学分会主委单位、亚太肝病联盟江西省联盟、江西省研究型医院学会消化分会主委单位、江西省研究型医院学会肝病分会主委单位、国家消化道早癌防治中心联盟挂靠单位、全国炎症性肠病（IBD）QCC培育中心、江西省炎症性肠病专科联盟成员单位、江西省食管疾病规范诊治基地、南昌大学消化专业博士、硕士学位授予点。
科室拥有一支高素质的爱岗敬业的医疗队伍，其中医护100余人（医生46名，教授/主任医师7人，副教授/副主任医师9人，主治医师19人，住院医师11人。有医学博士学位22名、硕士学位15名；江西省主要学科学术带头人、江西省青年科学家（井冈之星）及省新世纪百千万人才工程人选1人，归国留学人员4人。博士生导师1人，硕士研究生导师6人。医护人员技术精湛，科内学术氛围浓厚，通过有规律组织科室病案讨论及多学科病案讨论，大大提高了疑难重症疾病的诊治水平。
科室在历届主任的辛勤耕耘下逐步发展壮大；尤其是肝病方向，一直以来是科室的特色和强亚专科，为省肝病学分会的发展及省内肝病学事业做出了突出贡献。近5年，作为人才引进的学科带头人温志立主任，狠抓科室建设，使科室呈跨越式飞速发展，形成了医、教、研全面开花的良好局面。
科室业务量在其带领和全科人员共同努力下，不断增长，2021年门诊量16万余人次，入院人数9000余人次，平均住院天数为5.61天，病床使用率103%，内镜检查量10万人次；2021年度消化道肿物内镜下切除（ESD/EMR）手术量全省第一；肝病介入领域最高难度手术TIPS连续3年突破100台，处省内绝对领先，跻身国内优秀行列；代表着病种质量和难度的CMI值在2022年上半年位居全省消化领域第一；此外，科室在药物临床试验方面也有重大突破，近5年承接药物临床试验项目高达20余项。
科室现有东湖和红角洲2个院区，床位141张，占地面积约4000平方米，设置有门诊、普通病房、危重症监护病房、内腔镜室，示教室，药物临床试验受试者接待室及胃肠动力室等。
医疗设备齐全先进，拥有国内最先进的介入诊治及内镜诊治等设备。包括内镜主机18台、胃肠镜百余根，并配有高频电治疗仪、氩离子凝固治疗仪、超声内镜、双气囊小肠镜、胶囊内镜、十二指肠镜、胃肠动力仪、FibroScan等多种诊疗设备，介入治疗室拥有数字减影血管造影机等多台。
教学区域占地约300余平方米，教学设备完善。科室还拥有消化内科专用实验室，依托于南昌大学科研平台及南昌大学二附院分子生物中心。目前共有8个诊疗小组，分别为介入组、胆道组、肠病组、早癌组、肝病组、超声组、胰腺组及内镜组。
科室在消化系统疾病的治疗上居全省领先水平，部分治疗技术在国内先进水平。主要擅长：肝硬化和肝癌的综合治疗、各种常见肝病（如病毒性肝炎、脂肪肝、药物性肝损害、PBC等）及疑难肝病的诊治、消化介入治疗（尤其是肝病介入）、消化道早癌（ESD/EMR）、胆胰结石（ERCP）、急慢性胰腺炎、胰腺肿瘤超声内镜下诊治（EUS-FNA）、炎症性肠病等疑难肠病、常见急慢性肠病（结肠炎、肠结核、缺血性肠病等）、肝硬化伴食管胃底静脉曲张破裂出血、消化道出血、消化道息肉、消化性溃疡、食管炎、慢性胃炎、功能性胃肠病、幽门螺旋杆菌感染、内痔和阑尾炎内镜下治疗等。
不仅积累了丰富的诊治经验，并形成了以介入微创诊治及内镜微创诊治为主要手段的治疗模式，使科室从以诊断为主向以治疗为主的模式转变，科室的微创诊治水平达到国内先进水平，在解决患者病痛的同时减少了患者的创伤，大大减少患者的医疗费用。
科室还承担了南昌大学医学院本科生、消化专业硕士及博士研究生、社会规培生及进修生的临床教学工作。“双语教学”和“多媒体课件”教学深受学生好评，有两位老师被评为江西医学院中青年骨干教师。
共获国家自然科学基金课题20余项，省厅级课题（含省重点研发计划项目和省自然科学基金项目）共30余项，发表SCI100余篇，其他中文医学核心期刊、CSCD论文共300余篇；获医院“国自然基金申报最佳组织奖/申报组织奖”；在基因治疗消化道肿瘤的基础研究方面成果突出，尤其是肝癌的基因治疗及机制研究在国内位居先进行列，脂肪肝、肝纤维化及终末期肝病等慢性肝病的研究也有重大突破。
教学方面，目前共培养博士研究生30余人，硕士研究生100余人。承担南昌大学本科生实习带教工作，每年带教实习生500余名，接收省内及省外进修人员60余人次/年，进修结业考核合格率为100%，国家住院医师规范化培训专业基地，每年带教规培学员200余名。
经过多年发展，消化内科逐步形成自身的优势，尤其在肝癌的综合治疗、肝硬化的介入治疗、胆胰疾病的微创诊治、炎症性肠病等疑难肠病的多学科诊治、消化道出血、内镜下胃肠病诊治以及消化道肿瘤基因治疗研究领域，处于省内领先水平。全科人员精诚团结，不断提高临床业务水平，以精湛的医术为广大病友服务。