阜阳市人民医院感染科是一个集医、教、研为一体的临床科室，科室成立于2009年，科室开放床位46张，专科医师9名，其中高级职称1人，中级职称人员3人，初级职称5人，研究生5人。先后派多名骨干医生到上海、合肥等三甲医院进修。

感染科承担着全市各种感染性疾病的临床救治工作。科室主要治疗疾病包括各种肝脏相关疾病及感染性疾病，对各种肝病、疑难重症感染、不明原因发热诊治有丰富经验。