皖南医学院第二附属医院胸外科近年来发展迅速，现有床位23张，副主任医师2名，主治医师1名，住院医师3名。

科室常规开展微创胸腔镜下各类手术，包括：肺部肿瘤的切除术（肺肿瘤楔形切术、肺叶切除术、肺段切除术等）；胸腔镜下肺大疱切除术；食管癌根治术；纵隔肿瘤的切除；胸廓成形术；漏斗胸矫治术等。科室正致力于胸外科常见疾病的微创诊疗。

在积极开展各项工作的同时，不断加强与省内多家医院胸外科合作。安徽省胸科医院与科室有紧密合作关系，省胸科医院定期安排知名专家每周六上午在我院门诊坐诊并指导临床工作，进一步提高了我院胸外科人员的专业技术能力及手术能力，能够开展各类微创普胸手术。

2023年我院胸外科也与弋矶山医院胸外科达成合作关系，弋矶山医院专家常年在我院门诊坐诊。

科室积极承担临床教学任务，为培养高质素人才献计献策。