芜湖市中医医院肛肠科是安徽省中医肛肠专科联盟副理事单位，芜湖市“十四五”医学重点专科。该科成立于1958年，历史悠久，实力雄厚，科研能力强，享誉大江南北。

近年来，在继承和发扬肛肠科中医专科特色的基础上紧跟国内外肛肠外科先进水平，引进进口数字式电子结肠镜、结肠镜治疗设备、电脑彩色报告系统、美国强生痔环切吻合器、肠吻合器、微波肛肠治疗仪、射频治疗仪、影像诊断、肛管直肠测压、生物反馈治疗仪，直肠腔内超声检查等。

首位拥有安徽省德国进口经肛门内镜显微手术设备(TEM)等先进医疗设备，使肛肠科诊疗水平跃居全省领先行列。

该科有高级职称医师两名，其中一名是安徽省著名肛肠外科专家，资深主治医师六名，硕士研究生三名。国际造口师一名。

开设肛肠科门诊、肠造口门诊、专科专病专家门诊，病床设有55张。

开展结直肠肿瘤手术、低位直肠癌保肛手术、直肠脱垂规范化手术、复杂性肛瘘手术（LIFT术）、肛周脓肿根治术、吻合器痔上粘膜环切术（PPH）、痔疮自动套扎术（RPH）、痔疮传统手术治疗、出口梗阻性便秘的手术治疗、电子结肠镜下肠息肉及早期肠肿瘤切除术、慢性溃疡性结肠炎规范化治疗，年手术量达3000余台。先后承担市科委批准的二项科研课题，发表科技论文数十篇，《吻合器痔上粘膜环切术治疗重度痔临床应用》获得安徽省科技成果。

每年接收省内规培生、实习进修生数百人，成为皖南地区肛肠外科医疗、教学、科研基地。

该科先后研制了舒痔灵软膏、痔浴爽洗剂等数种纯中药制剂，因治愈率高，复发率低，痛苦小，术后并发症少而深受肛肠疾病患者的信赖和好评。