安徽中医药大学第二附属医院肿瘤科为2022年省级第二批优势专科，安徽省卫健委重点（培育）专科。

专科遵循“以人为本，中西医并重，针药并用”的原则，运用中医中药、静脉化疗、腔内灌注化疗、靶向治疗、免疫治疗等及针刺、艾灸、穴位注射、中药外敷熏洗、中药贴敷等综合手段治疗各类肿瘤，尤其擅长肺癌、乳腺癌、食道癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、胰腺癌等多瘤种的中西医结合诊治，在肿瘤放化疗、靶向治疗的毒副反应防治、晚期肿瘤患者的疼痛、疲乏、恶性胸腹水等综合调理等方面具有疗效优势。肿瘤科的宗旨是让肿瘤患者在得到西医规范化诊治的同时，充分发挥中医药优势。

专科拥有高级职称医务人员5人，现有江淮名医1人、安徽省名中医1人，专科主持和参加各级各类科研课题10余项，发表论文30余篇。