安徽中医药大学第二附属医院急诊科为医院独立的临床一级科室，是以内科系统疾病为主，集医、教、研为一体的医院窗口科室。作为医院的急诊救治中心，已成为全院急症抢救的中坚力量。急诊收费处、急诊药房、放射科、B超、化验室等辅助科室以急诊抢救室为核心合理分布，所有功能单元共同构成一有机整体，形成了一条快速、安全、有效的急救“绿色通道”，极大的方便了患者就诊。

急诊科拥有呼吸机、心电监护仪、快速血糖检测仪、心电图机、除颤监护仪、心肺复苏板、微量泵、输液泵、洗胃机、麻醉喉镜，气管插管包等救治急危重症病人所需的先进医疗设备。

除完成正常的医疗工作外，还承担安徽中医药大学本科生及硕士生的临床教学任务。所有医师均具有研究生教育背景或三甲综合性医院规范化培训经历，目前有国医大师学术经验继承人1名，副主任医师1名，主治医师3名，住院医师1名。

急诊科有一支朝气蓬勃、特别能战斗的医护队伍，在心肺复苏、急慢性脑血管病、眩晕、面瘫、周围神经炎、颈椎病，腰椎间盘突出症、颈肩腰腿痛等方面具有丰富的临床经验。多次承担省市各种大型活动的医疗安全保障任务。被医院授予“业务学习优秀科室”光荣称号，常年开展的医学知识科普，医疗义诊下社区活动受到了广泛好评。