合肥市妇幼保健院新生儿科目前设置床位55张，其中NICU病床12张，科室技术力量雄厚，现有各级医护人员48人，其中医生18人，有主任医师2人、副主任医师2人，主治医师8人，其中硕士研究生7人。

科室业务以诊疗极、超低出生体重儿、新生儿危重症、新生儿疑难杂症等各种新生儿疾病为主，尤其擅长早产儿的综合管理，对胎龄小于28周、出生体重在1000克以下的超、极低出生体重儿的抢救。

目前科室配备高频及常频呼吸机5台、无创高频呼吸机2台、NIPPV呼吸机2台、nCPAP呼吸机11台、HFFNC呼吸机2台，配备新生儿暖箱50余台，床旁心电监护仪器50余部，以及独立的血气分析仪、血糖监测仪等，近年来在安徽地区新生儿NICU率先使用无创高频通气技术治疗极、超低出生体重儿呼吸系统疾病，是省内设备及技术先进的新生儿病区和NICU之一。