台州市中心医院内分泌科成立于2000年6月，病房位于十病区，配备医生1名，后搬至A7西病区，配备医生3人。2005年6月病房搬至A座大楼5楼东面至今，现有床位15张，医生6人，包括主任医师1名，副主任医师1名，主治医师1名，另有糖尿病专科护士2名。科室对糖尿病及其慢性并发症、甲状腺疾病及其他内分泌代谢病如痛风、肥胖症、内分泌性高血压、脂代谢紊乱、骨质疏松症、肾上腺疾病、垂体疾病、多囊卵巢综合征等疾病诊断治疗技术较为成熟，设有糖尿病专科和痛风特色门诊。

科室拥有多台胰岛素泵治疗设施并对全院住院病人血糖管理；开展了糖尿病足病多学科联合诊治，加入浙南糖尿病足病联盟。2020.6.19加入国家标准化代谢病管理中心（MMC）。2019年科室出院人数562人，门诊人次37432人。