杭州市中医院神经外科，成立于20世纪80年代初，目前拥有正高级职称3人，副高级职称4人，中级职称4人，硕士学位者7人。目前拥有脑室内窥镜、数字减影血管造影机、磁共振、螺旋CT、手术显微镜、显微器械、颅脑多普勒等相关设备。能独立开展重症颅脑损伤、脑溢血、脑肿瘤、脑积水、脊髓肿瘤等一系列手术及脑血管介入诊疗手术。

尤其对于中西医结合治疗急诊神经外科疾病颇有特色，处于省内先进地位，近来与国内一流的神经外科保持着密切合作，每年定期选派人员去国内著名神经外科交流学习，进行疑难病理讨论。

在脑卒中的外科治疗（脑梗塞急性期取栓治疗，颈内动脉内膜剥脱术）颅脑创伤的微创治疗，脑血管病介入治疗，及颅内原发性或继发性肿瘤（脑膜瘤，胶质瘤，垂体瘤，畸胎瘤，松果体占位等）方面有丰富的临床经验。

同时和神经内科于2016年联合成立中西医结合脑病中心，弘扬中医特色，针对患者的神经康复治疗（急性期康复和终身康复），采用西医外科治疗，中医康复，醒脑开窍治疗。打造国内一流的中西医脑病中心。