浙江大学医学院附属第一医院胃肠外科，是集医疗、教学、科研和预防保健为一体的胃肠外科疾病诊治中心，是国家临床重点专科，亦是浙江省最早成立胃肠外科亚专科的单位。科室现有医生30名，其中主任医师5名，副主任医师4名，主治医师14名，具有博士学位15名。现有护士42名，其中副主任护师2名。科室是浙江大学医学院研究生培养单位，拥有博士生导师1名，硕士生导师2名，科室中多名成员具有海外研修经历。

胃肠外科开展以手术治疗为主要手段的胃肠外科疾病全程化管理，科室主要收治的病种涵盖胃肠疾病（胃肠道良恶性肿瘤、胃肠道息肉及憩室等，胃十二指肠溃疡等）；腹部肿块（腹壁、腹腔及腹膜后肿瘤等）；腹部外伤；各种消化道瘘；肠梗阻等急腹症（各种急慢性腹痛）；各种腹壁疝（腹股沟疝、各种切口疝等）；外科感染性疾病等。科室共有庆春、之江、余杭三个病区，现有床位142张，年手术量超过3000例。

胃肠外科主要规范化、精准化、微创化诊治胃肠道肿瘤、甲状腺肿瘤、腹壁疝、胃食管反流病、肥胖症、以及肠梗阻等胃肠道急腹症。科室在国内较早开展胃癌、肠癌的一体化诊治，包括开放及微创手术、化疗、靶向治疗、免疫治疗、营养治疗等，开展胃肠道间质瘤的以手术治疗、靶向治疗为主的综合性诊治，同时也在国内较早提倡腹壁疝的微创化治疗和腹股沟疝的日间手术治疗。