惠州市第三人民医院前身是1927年基督教复临安息日会创办的“惠安医院”，为惠州历史最悠久的医院，新中国成立后医院历经多次更名，于2009年由“惠州市人民医院”更名为“惠州市第三人民医院”。2013年成为“双一流”建设高校广州医科大学附属惠州医院。现已建成为一所集医疗、保健、康复、教学、科研、健管于一体的三甲综合医院。

医院设有两个院区(总院区、东院区)和一个分院(横沥分院)，形成“一体两翼”发展格局，总建筑面积：23.3万平方米。开放床位近2200张。医院年门急诊量190余万人次，年出院量近7万人次。

医院拥有在职员工近2800人，高级职称500余人。其中博、硕士研究生学历400余人，博士生导师2人，硕士生导师29人，高等医学院校兼职教师200余人。

拥有心血管内科、神经外科、康复医学科等省市级重点专科20个。并着力打造了心血管医学中心、神经医学中心、骨科医学中心、康复医学中心、健康管理中心、肾脏泌尿医学中心、消化医学中心、眼耳鼻喉口腔医学中心等优势学科群。

拥有KINEVO900机器人手术显微系统、天玑骨科手术机器人、直线加速器、三维后装近距离治疗机、大孔径CT模拟定位机、256排CT、3.0T核磁、数位平板血管造影机(DSA)、海扶刀聚焦超声肿瘤治疗系统、全飞秒激光手术系统等一批高端先进设备系统。

医院为全国人文爱心医院、全国模范职工之家、广东省抗击新冠肺炎疫情先进集体、广东省先进基层党组织、广东省医疗系统先进集体、广东省改善医疗服务行动计划示范医院、广东省学雷锋示范点、惠州市先进集体、全国白求恩精神教育基地。为广州医科大学研究生培养基地、暨南大学医学研究生培养基地、广东医科大学研究生培养基地、广东省博士工作站。

同时也是国家级冠心病介入培训基地、国家标准版胸痛中心、国家标准化心脏康复中心、国家标准版房颤中心、国家级标准版心衰中心、国家标准化体外反搏中心、国家标准化心肺康复专科护士/康复师培训基地、广东省标准版胸痛中心示范基地、全国防控重大慢病创新融合试点项目单位、全国健康管理示范基地、国家高级卒中中心、国家脑出血外科诊疗基地、国家神经介入建设中心、国家神经外科建设中心、国家级高级认知障碍诊疗建设中心、全国语言康复规培基地、全球超声无创治疗良恶性肿瘤技术产业化临床示范基地、全国危险性上消化道出血救治区域中心、中国男科基层实践粤东基地。

长期以来，医院始终坚持以人民健康为中心，坚定履行公立医院责任担当，落实健康中国行动。医院被中组部指定结对帮扶贵州省黔西南州册亨县人民医院。近十几年来先后与社会各界爱心组织联合开展了“复明工程”白内障筛查、“慈爱救心”贫困先天性心脏病儿童医疗救助、“惠州市耳聪工程”贫困听障儿童和耳疾患者医疗救助、“笑脸重现”贫困三叉神经痛及面肌痉挛患者医疗救助、“慧儿工程”惠州市孤独症儿童健康干预、“肠治久安”惠州市大肠癌筛查项目、成长天使基金“关注罕见病患，心系儿童成长”、青少年特发性脊柱侧弯健康筛查等公益慈善项目和健康帮扶志愿服务活动，为人民健康提供可靠保障，增进人民群众健康福祉，获社会各界广泛好评!

2023年，广东省2021年度三级综合医院绩效考核结果公布，惠州市第三人民医院在位居全省第25名、惠州市第一。