惠州市第三人民医院中医科为医院一级临床科室，是惠城区中医重点专科，广东省治未病联盟单位、广东省膏方联盟单位。设有病房及院本部、东院区门诊，有中医师共12人，其中惠州市名中医1人，主任医师4人、副主任医师4人，主治医师2人，住院医师2人。

可开展的中医适宜技术包括：针刺治疗、艾灸疗法、刮痧、中药热奄包、耳穴压豆、皮内针、雷火灸、中药外敷、灌肠等。住院部开展内科、常见病、多发病及部分疑难危重疾病的诊治，院本部、东院区门诊开设中医脑病、中医内分泌、中医胃肠病、中医肿瘤、中医妇科、老年病、中医呼吸道疾病、治未病等亚专科门诊，完成了多项省、市级科研课题工作，发表了相应的科研论文。