扬州市妇幼保健院肛肠科为一级科室，成立于二十世纪六十年代，原为“扬州痔科医院、全国中医肛肠学会扬州肛肠病治疗中心”，现为扬州市临床重点专科建设单位、中日友好医院医联体单位，是扬州市成立较早、市内具有一定技术实力的肛肠专科。现有医护人员11人，中级职称4人，硕士研究生1人。肛肠科采取中西医结合的疗法，博采众长，吸取中医药优势和现代手术的双重优点，成功开展了环状混合痔、高位复杂性肛瘘手术及康复治疗，尤其在高位复杂性肛瘘（肛周脓肿）的诊治方面，灵活运用中医挂线疗法，单挂线、双挂线、多重挂线、定向紧线多措并举，在有效保护肛门功能与提高疗效方面形成自己独特的理念、方法，从而提高了临床疗效，减少了临床并发症与后遗症，提高了病人生活质量；与影像科及盆底中心联合开展的具有国内先进水平的排粪造影技术及盆底检查技术，为顽固性便秘的患者提供了进一步诊断的方法，利用中医中药及电刺激、生物反馈等理疗方法进行相关非手术治疗；与超声科联合开展直肠腔内超声进一步明确高位复杂性肛瘘、肛周深部多间隙脓肿的诊断，提高一次性手术成功率。目前该科已开展PPH术，TST术，痔疮超声多普勒结扎术，自动痔疮套扎术等具有国内先进医疗技术，并且术后结合微波治疗、红光治疗、中药熏洗治疗、耳穴压豆等促进患者愈合，缓解术后疼痛及水肿，缩短住院时间。为广大具有环形痔、多瓣痔、巨大孤立痔、内痔、外痔、混合痔、环状痔、嵌顿痔、直肠粘膜脱垂、脱肛等的患者提供了安全，无痛，创伤小，见效快的方法。电子结肠镜：用于诊断大肠粘膜病变，通过安装在肠镜前段的电子摄像头将结肠粘膜的图像传输于电子计算机处理中心，显示于监视器屏幕上，可肉眼直接观察大肠粘膜的微小变化，如肿瘤、息肉、糜烂、炎症，充血等，其图像清晰。电子结肠镜还可以通过肠镜的器械通道送入活检钳取得米粒大小的组织，进行病理切片化验及其他特殊染色，对粘膜病变性质进行组织学定性，如炎症程度、肿瘤分化程度等进一步分级，有利于了解病变的轻重，指导制定正确的治疗方案。