南通大学附属医院始建于1911年，由爱国企业家的典范、民族企业家的楷模、民营企业家的先贤张謇先生携其兄张詧创建。2004年南通大学组建成立后更名为南通大学附属医院。医院现为江苏省属综合性教学医院、省级综合类医疗中心、江苏省研究型医院、江苏省高水平重点建设医院、综合性大学直属附属医院，是具有区域影响力的长三角北翼和沿海经济带高水平医疗服务高地。1994年首批获评为三级甲等综合性医院，1998年被确定为国际紧急救援中心网络医院。近年来，医院党委先后获评江苏省先进基层党组织、南通市先进基层党组织、江苏省卫生系统先进基层党组织、江苏省教育系统先进基层党组织等。医院先后获全国文明单位、全国改善医疗服务示范医院奖、全国节约型公共机构示范单位、全国模范职工之家，全国五四红旗团委等荣誉称号。
　　医院西院区（老院区）占地面积146亩，建筑面积23.8万平方米；东院区（新院区）占地面积281亩，建筑面积56.6万平方米，于2024年5月投入使用，两院区共开放床位3300余张。2024年总诊疗人次308.33万，出院人次18.06万，住院手术台次9.04万，三四级手术占比82.61%，四级手术率39.03%，平均住院日6.05天。现有职工4592名，高级职称915人（其中正高级职称373人、副高级职称542人），中国工程院院士2人，享受国务院特殊津贴专家22人。博士生导师51人、硕士生导师398人。

　　以我院为主体的南通大学临床医学学科为江苏省重点学科，是通过国务院学位委员会批准的临床医学专业学位博士点，临床医学ESI国际排名上升至1.861‰。医院现有国家临床重点专科建设项目4个，国家中西医协同“旗舰”科室建设项目1个，省级区域医疗中心3个（含1个建设单位），省级医学创新中心1个，省级医学重点学科5个，省级工程研究中心1个，省级质量控制中心4个，省级临床重点专科32个（含2个建设），省级中医重点专科（Ⅰ类）建设项目1个。医院首批通过国家卫计委干细胞临床研究机构认证，是国家高级卒中中心、中国胸痛中心、心衰中心、房颤中心，江苏省胸痛救治中心、创伤救治中心、卒中救治中心，江苏省孕产妇危急重症救治指导中心和江苏省新生儿危急重症救治中心。现任国家级学会专科分会委员及以上职务258人次，其中专科分会副主任委员及以上职务27人次；省级学会副会长、专科分会副主任委员及以上职务198人次，其中省医学会占 34人次，省医学会专科分会前任主任委员6名、主任委员4名、候任主任委员3名。
　　全院上下始终高举中国特色社会主义伟大旗帜，坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入学习贯彻党的二十大和二十届二中、三中全会精神，认真落实新时代党的卫生健康工作方针，秉持“大医精诚以宏慈善”院训，坚持“一个目标”，即全面建设省内顶尖、国内一流，医、教、研、管四核驱动的高水平研究型医院；突出“两个中心”，即医疗服务和员工福祉的中心地位；筑牢“三个基础”，即人才、团队、学科基础；打造“四项支撑”，即质量、技术、服务和运营支撑；秉持“五种理念”，即务实、特色、创新、同治、共享；实施“六大战略”，即精品服务战略、学科登峰战略、人才辈出战略、技术引领战略、科创突破战略、员工福祉战略；全面推进医疗强院“提质工程”、专科举院“筑峰工程”、科教兴院“强翼工程”、管理治院“智慧工程”、人才强院“荟萃工程”、公益铸院“怀民工程”、文化润院“品牌工程”、员工立院“幸福工程”八大工程，为建设“健康南通”夯基垒台、为绘就“强富美高”新江苏画卷增色添彩，奋力谱写中国式现代化卫生健康事业新篇章！