江苏省妇幼保健院小儿外科始建于江苏省人民医院成立初，后因学科建制改革后分散为各大普外科亚专科，2019年医院以通过引进易军主任为核心的小儿外科团队，于2019年在妇幼分院（暨江苏省妇幼保健院）制建了小儿外科。我科下设妇幼普外科及小儿外科病区，共有床位34张，其中家庭式病房2间。现有医师10名，护士9名，其中主任医师3名，主治医师2名，住院医师5名。
科室现常规开展0-14岁小儿外科常见病和成人胃肠外科常见病的诊断与治疗，包括新生儿外科、小儿普外科、小儿泌尿外科、小儿矫形外科和成人胃肠外科等常见病。包括但不限于小儿头颈部的包块及瘘管；会阴部的疾患及肛瘘。体表及消化道先天性的畸形；肝、胆、胰、脾、肾疾病、肝肾占位、胆总管囊肿、胰腺囊肿；疝、鞘膜积液，包茎，隐睾以及小儿外科急腹症以及体表及腹部的良性和恶性肿瘤等。
同时进行的腹腔镜微创手术，包括肥厚性幽门狭窄、十二指肠梗阻（肠旋转不良、环状胰腺、十二指肠闭锁）、先天性肛门闭锁、巨结肠根治、胆总管囊肿切除、胆道重建、卵巢囊肿切除、阑尾切除、麦克尔憩室切除、腹股沟疝修补、各种腹腔肿瘤切除等。
科室以胎儿和新生儿危、重症外科疾病的诊治为主攻方向，系统开展“先天性消化道畸形”的产前诊断及产后新生儿治疗“一体化”模式，自2019年开诊以来，已成功手术诊治多名肠闭锁患儿，同时正在开展肾积水、腹腔或体表肿瘤等先天性畸形的产前诊断与治疗。今后还将与儿科、放射科、病理科等多学科协作（MDT）进行小儿恶性肿瘤方面的联合诊疗。