南京市儿童医院血液肿瘤科成立于上世纪七十年代，目前已发展为为具有一定影响力的区域性儿童血液肿瘤中心。科室现有医护员工71名，其中专科医师24名，专科护士41名，5名实验室技术人员，另有专职博后1名。医生中主任医师3名，副主任医师8名，博士学位7人；有教授1名、副教授1名，科研型博士研究生导师1人，硕士生导师2人。科室目前年专科门诊量超过30000人次，住院病人6000人次。

科室开展了一系列特色临床方向：

开展异基因造血干细胞移植治疗儿童难治复发恶性血液病及骨髓衰竭性疾病、嗜血细胞综合征、免疫缺陷病、遗传代谢病等疾病，并是国内较早开展异基因造血干细胞移植治疗复发难治神经母细胞瘤技术的中心；独立设置安宁疗护病房，为恶性肿瘤及罕见病患儿终末期提供人性化关怀；积极参与CCCG及CCLG协作组，完成儿童急性白血病的MICM规范化诊断和分层治疗；开展多学科联合诊治儿童实体肿瘤；基于GD2单抗治疗高危、难治儿童神经母细胞瘤免疫治疗居全国领先水平。

近年先后获得国家自然科学基金3项，中国博士后科学基金2项，江苏省自然科学基金3项，及多项市厅级课题资助。每年在各类核心期刊发表论文十余篇，其中SCI论文3-5篇，获得江苏医学科技奖1项，并于2019年获得第11届宋庆龄儿科医学奖。