南京儿童医院康复医学科，创立于上世纪90年代，现有康复医师17名（硕导4名），其中主任医师4名，副主任医师5名，主治医师7名；治疗师36名，其中副主任技师1名，主管技师15名；康复护士13名。康复评估方面开展语言、智力、社交孤独症、运动、综合发育等评估。

治疗方面引进国际先进治疗理念和技术设备，开展粗大运动、精细运动、认知、语言及社交行为等全领域治疗。包括运动疗法(PT)、作业疗法(OT)、言语治疗(ST)、认知训练、构音训练、感觉统合训练、情景模拟、引导式教育、超早干预训练、ABA治疗、地板时光、孤独症家长课堂、TEACCH治疗、奥尔夫音乐、脑超声、经颅磁、肉毒毒素神经阻滞技术、水疗、悬吊运动训练（S-E-T）、减重步行训练、密集训练、矫形器、康复机器人、口腔按摩、施罗斯体操、注意力训练、书写障碍训练和阅读障碍训练等。

近年来在SCI及国内核心期刊发表论文60余篇，先后承担国家级科研课题及省市级科研课题20余项。参与制定儿童康复领域国内指南或专家共识多项。承担南京医科大学、南京中医药大学、南京体育学院、南京特殊教育学院、南京健康职业学院、南京卫校的康复专业的理论教学和临床带教，并为上述学校的实习基地，累计培养硕士研究生20余名。