南京医科大学第一附属医院儿童保健科，成立于2005年，是江苏省妇幼健康重点学科，南京医科大学儿科学硕士、博士学位授予点；江苏省预防医学会儿童保健专业委员会主委单位、江苏省妇幼保健协会托幼机构儿童保健专业委员会、江苏省妇幼健康研究会儿童早期发展专业委员会主委单位。科室目前承担全省基本公共卫生项目0-6岁儿童健康管理及全省托育托幼机构儿童保健的管理和培训指导任务，参与全国及省内多项儿童保健相关技术规范的制订。

学科设有儿童生长发育、儿童营养、儿童心理卫生、儿童眼保健、儿童听力保健、儿童康复与早期发展等亚专科，并设有婴幼儿过敏预防、母乳喂养咨询等特色门诊，科室以儿童生长发育及营养性疾病的评估与矫治、儿童心理行为的评估与干预、高危儿童早期干预、儿童康复、儿童眼及视力保健和耳及听力保健专科为特色，全面维护和保障儿童的身心健康。学科的主要优势发展方向为儿童心理保健及儿童早期发展和干预，是省级儿童早期发展示范基地。

目前科室拥有专业技术人员32人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师8人，具有博士学位3人，博士在读3人，硕士学位专业人员16人。近3年获得国自然课题2项，省厅级课题多项，省妇幼新技术引进奖1项，江苏省预防医学科技进步奖1项，发表科研论文17篇，其中SCI收录7篇。