广州医科大学附属肿瘤医院病理科成立于1987年，目前已发展为集医教研为一体的重要科室之一。科室现有高级职称4人，中级职称2人，初级职称2人，其中获有博士学位者1人，硕士学位者6人。医师均具有丰富的肿瘤病理诊断工作经验，技术人员也具有丰富的病理技术经验。能出色地完成病理诊断任务工作，是一支技术力量较强的队伍。
科室承担着全院所有临床病理诊断工作及病理会诊工作。每年病理活检量约为8000人次，细胞学检查6000人次，病理冰冻检查700人次，外院病理会诊1500人次。各项病理技术开展完备。免疫组织化学染色是目前病理诊断最普遍应用的辅助诊断技术，尤其对肿瘤的诊断和分型具有重要的作用。
病理科具有大量开展免疫组化染色的条件和技术力量，每年的免疫组化染色片达9000张以上，并且在持续增加。随着分子病理技术的快速发展，病理科已开展多项分子病理诊断新技术，如原位杂交技术、荧光原位杂交术（FISH）等，这些新技术的开展将为乳腺癌、肺癌、胃肠道肿瘤和鼻咽癌等多种肿瘤的诊断及临床合理治疗提供更可靠的病理依据。
病理科拥有先进的现代化仪器和设备，具有病理组织切片的全套设备，包括全自动脱水机、全自动染色机、全自动封片机、冰冻切片机以及二维码全自动免疫组化染色机、液基细胞学等先进仪器，硬件设施已达到国内先进水平。