胃黏膜活检一般依据医生在内镜下观察到的具体情况而定，并非所有患者均需进行活检。一般如果胃黏膜有溃疡、息肉、肿块、糜烂等病变时，会取胃黏膜进行病理检查，主要目的是明确病变性质。此外，部分炎症性病变也需进行胃黏膜活检，如慢性胃炎患者确诊胃炎具体情况时，需确认是否发生萎缩、肠化，是否处于急性活动期等。活检流程为取活检组织送病理科；病理科核对、登记；病理科医生取材、制片、阅片。

明确诊断、指导治疗。免疫组化的应用部位较多，其主要作用为明确诊断及指导治疗，在当前的病理检查中应用较为广泛，经此检查90%甚至95%以上的肿瘤可获得明确诊断。对于乳腺癌来说，其诊断较为明确，但常行雌激素、孕激素、HER-2、Ki-67检查以辅助进一步治疗。若ER、PR检查为阳性，可采取内分泌激素的治疗；若为HER-2阳性，可采取赫赛汀治疗。