航天中心医院康复医学科，位于住院部南楼二层最南侧，于1999年在医院和海淀残联共同支持下由原来的理疗科转型而成，经过不断的发展，现科室人员共计21人，包括医师5人技师16人

康复医学门诊包括康复医学普通门诊、专家门诊和康复手法治疗特色门诊。主要就诊患者群为中枢及外周神经系统、运动系统等疾病所致功能障碍及颈肩腰腿痛的患者等。目前康复医学科的技术可覆盖到物理因子（电、光、声磁、热）、牵引、手法治疗、冲击波治疗、运动疗法、作业疗法、言语治疗等多种治疗类别，主要接诊对象为颈椎病、腰椎间盘病变、肩周炎、骨关节病、各种急慢性损伤、慢性炎症、脑血管病、脊髓损伤、骨折及关节置换术后需要功能康复的患者。

康复医学科经过多年的技术传承、引进和沉淀，已经逐步形成以中枢系统和运动系统疾病康复为基础，以运动损伤及脊源疾病康复为特点的技术模式。并成为拥有“施罗斯（Schroth）脊柱侧弯矫形体系”资质认证的医疗机构。