上海市第一人民医院消化科由我国著名的消化病学专家巫协宁教授始创于1985年，经过半个世纪几代消化科医生的艰苦努力，学科发展进入新的历史阶段。

现为上海市胰腺疾病重点实验室、上海交通大学医学院胰腺疾病研究所、上海交通大学硕士、博士学位授予点和博士后流动站，卫生部消化内镜培训中心、住院医师和专科医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构、上海交通大学炎症性肠病诊治中心所在单位，中华医学会消化病学分会常务委员、中华医学会肝病学分会副主任委员、上海市医师协会消化分会会长和上海市肝病学会主任委员所在单位。

消化科目前共有医师48人，其中博士学位39人，硕士学位7人;正高级职称10人，副高级职称13人。消化科床位总数175张，包括北部117张张和南部58张。科2023.7.3:上花室目前分设胃肠疾病、肝胆疾病、胰腺疾病及消化内镜诊治亚专业。形成了重症胰腺炎综合治疗、炎症性肠病、慢性疑难肝病、消化道早癌防治和消化内镜诊治胃肠和胆胰疾病等医疗特色，并处于国内先进水平，吸引了大量本地和外地惠者。

每年全科平均出院惠者6700人次，门诊277330人次，内镜诊断和治疗9万例次,这些指标均据上海前列。科室承担国家科技部“863”、“973”、“十一五”、“十二五”和“十三五”重大专项、教育部新世纪优秀人才支持计划、卫生部重大科研项目及国家自然科学基金等国家级课题80余项，获得国家科技进步成果奖二等奖1项，上海市科技进步一等奖1项、三等奖6项、教育部科技成果二等奖3项、上海医学科技奖二等奖2项、中华医学科技奖三等奖2项等。