上海天佑医院呼吸内科是医院的重点学科，以一批具有中高级职称的医师为骨干的团队。2017年与上海瑞金医院、上海仁济医院、同济大学附属东方医院成为“国家呼吸临床研究中心暨中日医院呼吸专科医联体间质性肺疾病协作组成员单位”。

该病区已连续两年被评为“优质服务示范病区”。科室开设呼吸内科专家门诊、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、肺结节诊治专病门诊。

专家团队在开展内科胸腔镜下治疗恶性胸腔积液等恶性疾病方面具有丰富经验，擅长治疗上下呼吸道感染、社区及医院获得性肺炎、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、自发性气胸、支气管扩张、支气管哮喘、胸腔积液、肺癌、间质性肺病（包括肺纤维化）等疾病。